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企业有残疾人，可以申请免税，按照人头免税。
1、首先，企业支付给残疾员工的工资可以从所得税中予以扣除，并且可以100%加计扣除，
2、增值税、营业税：对安置残疾人的单位，实行由税务机关按单位实际安置残疾人的人数，限额即征即退增值税的办法。实际安置的每位残疾人每年可退还的增值税或减征的营业税的具体限额，由县级以上税务机关根据单位所在区县(含县级市)适用的经省级人民政府批准的最低工资标准的6倍确定，但最高不得超过每人每年3.5万元。
3、最后，雇佣残疾员工达到规定比例，可以免缴残疾人就业保障金。各地还有一些富有地方特色的优惠政策，各企业还需具体和地方残联或地税咨询。
法律依据：《中华人民共和国营业税暂行条例》第八条 下列项目免征营业税：
（一）托儿所、幼儿园、养老院、残疾人福利机构提供的育养服务，婚姻介绍，殡葬服务；
（二）残疾人员个人提供的劳务；
（三）医院、诊所和其他医疗机构提供的医疗服务；
（四）学校和其他教育机构提供的教育劳务，学生勤工俭学提供的劳务；
（五）农业机耕、排灌、病虫害防治、植物保护、农牧保险以及相关技术培训业务，家禽、牲畜、水生动物的配种和疾病防治；
（六）纪念馆、博物馆、文化馆、文物保护单位管理机构、美术馆、展览馆、书画院、图书馆举办文化活动的门票收入，宗教场所举办文化、宗教活动的门票收入；
（七）境内保险机构为出口货物提供的保险产品。
除前款规定外，营业税的免税、减税项目由国务院规定。任何地区、部门均不得规定免税、减税项目。
公司法人是残疾人有什么优惠政策
一、残疾人的登记注册费用可以减半收取；
二、残疾人如果创业注册公司，办理了企业法人的营业执照，可以享受2万元的创业扶持；
三、残疾人注册公司地址的租赁费用，有最高2万元的政策扶持；
四、残疾人如果注册个体户的，可以享受扶持最高5千元；
五、残疾人如果是个人提供的劳务，是能免征营业税的；
六、残疾人如果注册的公司规模较小的修理业，工业，商业的，那么他们的登记费用，管理费用。
残疾人开办公司的税收优惠政策有：
1、可以减征个人所得税，具体幅度和期限，由省、自治区、直辖市人民政府规定，并报同级人民代表大会常务委员会备案；
2、对残疾人从事个体经营的，应当依法给予税收优惠，有关部门应当在经营场地等方面给予照顾，并按照规定免收管理类、登记类和证照类的行政事业性收费；
3、国家对自主择业、自主创业的残疾人在一定期限内给予小额信贷等扶持。
残疾证的八大好处是：
1、残疾人凭《中华人民共和国残疾人证》在市区的公园内享受免费，但在郊区一些特殊景点不免费。
2、搭乘火车、飞机，优先购票和搭乘。
3、市内公共汽车免费。
4、其随身必备的辅助器具免费携带。
5、残疾人专用交通工具可就近免费停放。
6、盲人读物普通邮件免费寄递。
7、残疾人就医，优先挂号、就诊，盲人、双下肢残疾人、多重残疾人免交挂号费。
8、残疾人免费进入博物馆、纪念馆、科技馆（宫）等场所。
法律依据：
《残疾人保障法》
第三十六条国家对安排残疾人就业达到、超过规定比例或者集中安排残疾人就业的用人单位和从事个体经营的残疾人，依法给予税收优惠，并在生产、经营、技术、资金、物资、场地等方面给予扶持。国家对从事个体经营的残疾人，免除行政事业性收费。
公司法人是残疾人，如果法人代表在单位有工资薪金所得，在计算企业所得税的时候，残疾人工资可以加计扣除100%。
可以减免相应的残保金，应缴费额＝（上年度单位在职职工总数×1.5%—上年度单位实际安排残疾人数）×上年度本单位职工年平均工资。
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